Desa Mandaong merupakan salah satu desa yang terdapat di Kecamatan Bacan Selatan, Kabupaten Halmahera Selatan, Provinsi Maluku Utara. Awalnya, desa ini terletak di sebelah utara Sungai Mandaong, tetapi karena sering dilanda banjir sehingga dipindahkan di sebelah selatan Sungai Mandaong oleh partai PNI Marhain, partai Presiden Soekarno pada masanya, atas inisiatif beberapa tokoh masyarakat. Desa Mandaong berdiri pada tanggal 27 November 1927. Nama Desa Mandaong itu sendiri dibentuk oleh Kesultanan Usman Syah.
Pemerintahan desa ini, pertama kali dipimpin oleh Masuara Bayau pada tahun 1915-1944 yaitu selama 29 tahun. Suleman Taradjudin meneruskan kepemimpinan selama 2 tahun dari 1945-1947. Kemudian pada tahun 1948-1973, Abd Basir Ahmad Tarafanur menlanjutkan kepemimpinan desa ini. Pada tahun 1974-1999, desa ini dipimpin oleh Ibrahim Taradjudin. Pemerintahan desa ini kemudian dipimpin oleh Yusuf Saha selama 14 tahun yaitu dari tahum 2000-2014. Kepemimpinan tersebut dilanjutkan oleh Zulkifli Robo dari tahun 2017-2022. Pemimpin atau Kepala Desa Mandaong saat ini yaitu dipimpin oleh Wahyudi Samad sejak tahun 2023 hingga sekarang.
Pemimpin desa dahulu dinamakan "Mahimo" (di kepemimpinan Masuara Bayau sampai Abd Basir Ahmad Tarafanur), setelah "Mahimo" menjadi "Kepala Kampung" (di kepemimpinan Ibrahim Taradjudin). Selanjutnya diganti menjadi "Kepala Desa" sejak kepemimpinan Yusuf Saha di tahun 2000.